谋篇与布局就是对论文的内容表述做出合理的安排，包括用什么样的结构和形式来表达论文的内容，选择哪些材料来充分有效地表达论文的主题。即使再好的立意，也必须通过谋篇与布局才能对内容的表达作出有条有理的安排。如果没有严谨的结构和合乎逻辑的层次、段落、开头、结尾、过渡和照应的安排，就无法实现写作的目的。下面，蓝译编译就医学论文结构设计中各部分的写作及注意事项进行阐述。
一、文题。对于一篇文章来说，好的文题可以引起读者强烈的阅读兴趣。因此，每个作者都应根据自己文章的内容，用最简洁、最鲜明的语言来拟定文题。文章标题与主题思想的关系是非常密切的。写作时要注意主题集中、鲜明、新颖，而好的文题就直接揭示了文章的主题，通过文题就能知道文中要说明的主要内容。所以文题一定要仔细斟酌，言简意赅，立意新颖，要能反映出研究的目的及其重要意义。
那么，什么样的文题才称得上是一个好的文题呢？首先，文题要准确、贴切，作者易出现的问题就是文题不够确切，文题没有概括文章的主要内容；其次，文题要简洁精练，也就是在完整、准确地概括全文内容的基础上，用尽量少的文字作为标题，切忌拖泥带水；第三，文题中尽量不要使用标点符号；第四，文题中尽量不用中、英文缩略语，以免产生歧义；第五，不可滥用“研究”一词，有些作者存在错误认识，以至于一些研究性不强的论文文题也很牵强附会地使用“研究”。
二、前言。作为论文的开端，前言作用是使读者对文章的主旨有一个概括的了解，以引出下文。前言的内容一般要突出本课题研究工作的历史和现状，提出本文的研究目的意义、科学假设、实验设计、预期结果，而且要有与本课题相关的文献回顾，说明前人所做的工作，有哪些证明和结论，有什么问题还没有解决。前言不仅要简明扼要、开门见山，而且要突出新意。这部分篇幅不宜过大，不应与中心内容重复。
撰写前言要注意的是：(1)前言不是历史，更不是综述，一般～字为宜；(2)前言中不要出现“文献未见报道”、“前人未研究过”、“国际先进”或“国内首创”等字样，对前两种提法，必须经严格检索；对后两种提法，需经鉴定，没有确凿把握，不要轻易下此结论；(3)不要将结果、结论，甚至方法写在前言中。
三、材料与方法。材料与方法是医学科学研究的基本条件和手段，也是判断论文科学性、先进性的主要依据。因此本部分一方面是通过客观的描述，使读者清楚地了解本研究工作的对象和过程，以便理解和评价研究结果，另一方面，是使读者能够应用同样的材料和方法对研究结果进行验证和仿行。任何科学成果，必须能够在同样的条件下重复出同样的结果，才能得到公认。
这部分需要注意的是：(1)当报告以人为研究对象的实验时，必须要符合伦理学标准并获得批准，并要取得受试对象的知情同意；(2)任何临床观察，都必须有足够的病例；(3)随机分组应交代随机化的方法，不可用“随机分组”几个字简单表示；(4)分组时各组间必须具有可比性；(5)数字有误或前后不一致；(6)临床研究随诊的重要性不能忽视；(7)不要将结果写在方法中，这是作者容易犯的一个常见错误。
四、结果。结果是对本课题研究所获得的成果的阐述，是经过处理和整理的、能够说明问题的有关数据，是论文的核心内容及得出结论的依据，也是讨论推理的基础。结果不应简单地罗列研究过程中得到的各种原始材料和数据，而必须将其归纳分析，进行必要的统计学处理，得出相应的结论。然后，用文字和图表表达出来。结果的表达要真实准确，不能有任何虚假。
这部分需要注意的是：(1)不论结果是阳性还是阴性、是肯定还是否定、是符合预期还是不符合预期、临床应用成功还是失败，都应如实反映；(2)实验检查及其他特殊检查情况要有量化指标，不能笼统说升高或降低；(3)结果宜以文字为主，凡文字可说明，不必用图表，但用文字说明太冗长，而用图表可一目了然者，宜用图表，但应压缩文字，图表内容与文字不宜重复，避免文表不一、数据有误；(4)避免把结果和讨论混合在一起。
五、讨论。讨论对调查、观察或实验结果的综合分析和理论说明，应围绕主题，有针对性地进行，避免文字堆砌。这部分应强调指出研究获得的新的重要结果和结论；应说明研究的价值和局限性，如有其他相关研究，应阐述其间的关联；要与研究的目的结合起来讨论，避免妄下研究结果不支持的结论；除非做了经济学分析，一般不应下成本一效益方面的结论；要避免强调和暗示尚未完成的工作的重要性，如果有把握，可以提出新的假设和建议。
这部分常见问题有：(1)只是重复材料和方法、结果等内容，没有做出深人的分析，导致言而无物；(2)大量罗列文献尤如文献综述，讨论中虽引用了大量的国内外相关文献，却很少提及与本研究的相关与异同，未分析出本研究的创新所在，也未提出下一步设想；(3)撇开自己研究结果，夸夸其谈，照抄照搬别的文章；(4)立论时，仅凭个人的印象、经验，想当然摆出一种观点。
六、参考文献。参考文献反映了某一领域的研究进展和已有学术研究问的相互关系，通过引用参考文献，作者将自己的研究与前人或他人的研究联系在一起。参考文献是尊重前人和他人的工作、严谨作风的体现，参考文献著录规范、严谨，可以提升科研论文的科学性和可信度。被列入的参考文献应仅限于作者亲自阅读过的资料，严禁转录。作者在正文中引用文献处应该用上角标标出，以便读者查阅。
这部分存在的问题有：(1)虽然参考了文献却不列出，文中许多数据或理论无出处；(2)在文后列出文献，在文内却无标示；(3)文内引用的作者名和文后列出的不符；(4)著录格式不规范，项目不齐全，如有的缺少文章题目，有的缺少出版地或出版者等。