参考文献是医学书刊的一个重要组成部分，特别是医学论文，参考文献引用得是否正确、书写是否符合标准，已成为考核医学论文和医学期刊质量的一项指标。
我国于年分布了国家标准——GB-87《文后参考文献著录规则》，年进行了修订GB-《文后参考文献著录规则》，年再次进行了较大的修改，更名为GB/T-《信息与文献参考文献著录规则》。
论文后的参考文献表可有两种：一种是作者在论文中引用某些文献的参考文献表，置于正文之后；一种是作者推荐可供读者参考的有关本研究课题的文献题录，作为著作附录部分。
参考文献书写格式国家标准《信息与文献参考文献著录规则》（GB/T－）指出，“参考文献”是指“对一个信息资源或其中一部分进行准确和详细著录的数据，位于文末或文中的信息源”，分为“阅读型参考文献”和“引文参考文献”。前者指“著者为撰写或编辑论著而阅读过的信息资源，或供读者进一步阅读的信息资源”；后者则指“著者为撰写或编辑论著而引用的信息资源”。一般而言，论文只著录引文参考文献，对阅读型参考文献可酌情按注释处理。
引文参考文献的标注体系有“顺序编码制”和“著者?出版年制”。前者指引文采用序号标注，参考文献表按引文的序号排序；后者指引文采用著者?出版年标注，参考文献表按著者字顺和出版年排序。其中，顺序编码制为我国学术书刊所普遍采用。
1．文内标注格式采用顺序编码制时，在引文处，按它们出现的先后用阿拉伯数字连续编码，并将序码置于“[]”内，把序码作为右上角标，或者作为语句的组成部分。一般按以下3种格式，将文献序号置于方括号内加以标记
（1）引文部分写出作者姓名的，角码置于作者姓名右上角。
（2）引文部分未写出作者姓名的，角码置于引文之后右上角。
（3）引文的序号作为正文文句的组成部分，则不用角码标注，而用与正文相同的字体字号的数字书写。
示例1：Matsushita等[8]和Sischoff等[10]研究发现，从食管到右半结肠，嗜酸性粒细胞数目是增加的。
示例2：有研究显示，香烟烟雾刺激产生的炎性反应被认为可能关联到肺肿瘤的生长［10］。
示例3：按照参考文献［5］的方法，用淋巴细胞分离液收集人外周血中的单个核细胞。
这里，[8]、[9]、［10］作为引文注，用上角标形式表示；而[5]是语句的组成部分，不必写成角标。对于同一处引用多篇文献，应将各篇文献的序号在“[]”内全部列出，各序号间用“，”，如遇连续序号，起讫序号间用“-”连接。对于多次引用同一著者的同一文献时，在正文中标注首次引用的文献序号。
2．参考文献表的著录格式GB/T－《信息与文献参考文献著录规则》要求的，主要文献著录格式及举例如下：
（1）专著
[序号]主要责任者．题名：其他题名信息[M]．其他责任者．版本项（第1版不写）．出版地：出版者，出版年：页码．
[1]吴以岭．脉络论[M]．北京：中国科学技术出版社，：．
[2]GoldmanLSchaferAI．西氏内科学[M]．王贤才，译.24版．北京：北京大学医学出版社，：．
（2）专著中析出的文献
[序号]析出文献主要责任者．析出文献题名[M]//专著主要责任者．专著题名：其他题名信息．版本项．出版地：出版者，出版年：析出文献的页码．
[3]俞茂华，杨永年，叶红英．糖皮质激素的内科临床应用[M]//陈灏珠，林果为，王吉耀．实用内科学.14版．北京：人民卫生出版社，：-．
[4]BonowRO．Guidelinesforinfectiveendocarditis［M］//BonowRO，MannDL，ZipesDP，etal．ATextbookofCardiovascularMedicine.9thed．Philadelphia：ElsevierScience，：-．
（3）期刊析出的文献
[序号]作者．篇名[J]．刊名，出版年份，卷号（期号）：页码．
［5］程国涛，袁劲松，余开湖，等．中枢神经细胞瘤的影像学表现及其临床价值［J］．疑难病杂志，，13（1）：42-45．DOI：10./J．issn-..01.．
［6］LudkeAR，MoseleF，Caron-LienertR，etal．Modulationofmonocrotalineinducedcorpulmonalebygrapejuice［J］．JCardiovascPharmacol，，55（1）：89-95．DOI：10./FJC.0bec87a9d．
（4）报纸析出的文献
[序号]作者．题名[N]．报纸名称，出版年份-月-日（版次）．
［7］陈敏华．中晚期肝癌射频消融治疗［N］．中国医学论坛报，-06-30（B2）．
（5）学位论文
[序号]作者．题名[D]．培养单位所在地：培养单位，出版年：页码．
[8]滕军燕．缺血性心血管病风险评估模型的建立与研究[D]．济南：山东大学，：50-52．
（6）电子文献
A．期刊论文网络电子版
[序号]作者．题名[J/OL]．刊物名称，年，卷（期）：页码[引用日期]．获取或访问路径．
[9]江向东．互联网环境下的信息处理与图书管理系统解决方案[J/OL]．情报学报，，18（2）：4[-01-18]．