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博士生涯终于走到了最后一步了。这次全程用R和Rmarkdown相关的包完整写完了论文，现在总结一下个人经验和踩过的坑，希望给后来人提供参考经验，同时安利一下Rmarkdown这个提高生产力的工具。
选择Rmarkdown的理由大部分大学的毕业论文对排版都着严格的排版要求，具体需要注意的细节可能有
图表要编号，并经常需要在文中交叉引用引用文献，文中和文尾的参考文献格式需要注意目录，图和表的目录页眉页脚，字体字号行间距，标题副标题大小等等个人感受而言，传统Word虽然易用，但所见即所得式的编辑模式会将作者很大一部分精力吸引到“排版”工作上，另外大部分论文插图较多，排版也很困难。而作为另一条路的LaTeX则功能强大然而语法复杂。LaTeX将文本与排版结果分离，学习曲线陡峭。使用LaTeX颇有为码字而先修炼成排版工人的感觉。相比Word的上手容易精通难和LaTeX的复杂功能，个人觉得Rmarkdown易用性和功能性之间达到了较好的平衡。Rmarkdown既可实现LaTeX完全相同的最终论文排版效果，同时markdown语法简单易上手，学习成本相较LaTeX大为降低，直逼Word。另外，使用Rmarkdown还能生成gitbook的电子书，相较pdf格式也有良好的在线阅读体验（见gitbook在线电子书版