GraphPadPrism——论文绘图必备
GraphPadPrism是一款专门为医学专业人士设计的绘图软件,同时也兼顾统计分析的功能,操作便捷,可以帮助我们轻轻松松绘制出高质量的专业图形,简直就是科研人员的福利。下面我们以GraphPadPrism7为例,来介绍一下如何绘制回归分析结果的森林图。1.新建GraphPadPrism文件在NewTableGraph下选择Column,利用软件提供的Metanlysis(Forest)plot教程数据新建一个GraphPadPrism文件。2.录入数据按照软件提供的教程数据模板,录入对应的变量名称、HR值以及95%CI。3.点击Graphs下级目录中的Metanalysis,即可发现软件已经自动生成了一个森林图雏形,但是我们还需要对图形的一些细节进行进一步调整。4.调整坐标轴:双击坐标轴,进入FormatAxes界面4.1首先,在FrameandOrigin选项卡中设置坐标轴的起点(即无效线的坐标点),图形的形状、大小、位置,坐标轴的颜色、厚度等参数。4.2然后,在Xaxis选项卡中设置X轴的参数,主要包括刻度范围,刻度方向、长度,X轴的起点和增量等信息,同时在TitlesFonts选项卡中设置变量名称与Y轴的距离。5.调整图形元素:双击图片,进入FormatGraph界面5.1首先,在Appearance选项卡中设置图形各个元素的细节,包括颜色、形状、大小、厚度等信息。5.2然后,在DataSetsonGraph选项卡中调整变量名称的顺序。此时再次点击Graphs下级目录中的Metanalysis,发现经过调整后的森林图如下图所示,已经基本符合要求了,但总觉得少一些什么。6.插入数据文件如果想在森林图中进一步添加HR值、95%CI及对应的P值,可以在图形处单击右键,选择InsertObject→ExcelObject,插入一个Excel文件,录入对应的数值即可。最终生成的森林图如下所示,就可以直接导出放在文章中了哈。Excel——办公居家标配
Excel作为Office办公三件套的标配之一,其处理数据和绘图的功能也是非常丰富的,它的强大足够超乎你的想象。相信大家对Excel的操作已经很熟悉了,那么怎样利用Excel绘制森林图呢?我们以Excel为例,虽然Excel里并没有直接提供绘制森林图的图形模板,但我们可以另辟蹊径,通过选择“插入→图表→所有图表→股价图→收盘图”来绘制森林图的雏形,如下图所示。(Excel中录入数据)
这是一个旋转了90°的森林图,我们在上一期内容中也介绍了类似的森林图,这种类似的图也经常能够在文献中看到,例如年发表在ArteriosclerThrombVascBiol杂志(影响因子:6.6)的一篇文章《High-DensityLipoproteinCholesterolandMortalityTooMuchofaGoodThing?》。文中为了表达HDL-C水平与全因死亡之间的关联性(HR值),就采用了这种旋转了90°的森林图来表达分析结果,是不是和上面用Excel做出来的森林图雏形很相似呢。根据这种绘图风格,小咖深深怀疑这6.6分文章里的森林图就是用Excel搞定的。。。下面,在这个图形的基础上,我们可以对图形的一些细节进行加工,包括字体、颜色、坐标轴刻度、交叉点等等(此处省略……字),修改完之后再将图形旋转回来就OK了,如下图所示。操作过程好像听上去很简单,不过大家可能更关心的是“此处省略……字”的这个部分,到底怎样对图形的细节进行调整呢?没关系,为了尽可能给大家提供方便,小咖已经做好了一个Excel图表的模板(ForestPlot.crtx),安利给大家。可以把这个文件放在Excel默认的模板目录下面,小咖电脑中的目录为(C:\Users\Administrator\AppData\Roaming\Microsoft\Templates\Charts),大家可以根据自己电脑安装的目录进行寻找。然后,当我们再次打开Excel时,选择“插入→图表→所有图表→模板”,就可以看见添加进去的森林图模板了。有了这个模板,大家就可以把自己的数据直接Copy进去就大功告成啦。此外,如果还是觉得上面的森林图显得有些单薄,我们还可以将做好的森林图再插入到Excel的表格中,把图形和数据进行结合,使得看上去更加高大上哈。参考文献:
[1]JAmCollCardiol.;68:-55
[2]ArteriosclerThrombVascBiol.;38:-72
(有需要GraphPad模板和Excel图表模板的伙伴,可以电脑打开医咖会