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13种KRAS突变检测技术的主要区别

及其在临床应用中的相关性

简介

KRAS基因是重要的非小细胞肺癌驱动基因,KRAS检测也常用于指导结直肠癌(CRC)治疗,本研究旨在通过盲测方法评估临床应用可选的13种KRAS突变检测方法及其功能特性,检测不同突变检测平台准确鉴定野生型背景下KRAS突变区分低水平的拷贝数变异的能力。

方法

采用五种KRAS突变细胞系研究五种临床相关的KRAS突变:p.G12C、p.G12D、p.G12V、p.G13D和p.Q61H。分别采用定量PCR(qPCR)(n=3)、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)(n=2)、新一代测序(NGS)(n=6)、数字PCR(n=1)和Sanger毛细管测序(n=1)方法处理50份低拷贝数(50和)细胞系混合物(频率20%、10%、5%、1%和0.5%)。研究各方法间重要性能差异、特定检测方法的灵敏度及出结果时间。

结果

13种技术正确识别了总计/个数据点。5/6的NGS平台报告的各样品等位基因频率相似。1种NGSAssay检测到低至0.5%的突变,并正确识别了所有56份样品(On







































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