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论文：XPG多态性与中国人群胃癌易感性的关系（AssociationbetweenXPGpolymorphismsandstomachcancersusceptibilityinaChinesepopulation）
摘要
色素干皮病G组(XPG)蛋白在DNA修复过程中起着重要的作用，通过在3‘端切割受损的DNA。以前的研究表明，XPG基因的一些多态性与胃癌的易感性有关。医院的病例对照研究，以评估四个潜在的功能性XPG多态性(rsCT，rsCT，rsTC和rsGA)与胃癌易感性的关系。对例胃癌患者和例健康对照者的4个单核苷酸多态性(SNPs)进行了基因分型。采用Logistic回归分析，采用优势比(OR)和95%置信区间(CIS)评估兴趣关系。在研究的SNPs中，XPGrsGA多态性与胃癌易感性显著相关。
材料和方法
学习人口
目前的病例对照研究包括例胃癌病例和名健康对照者，分别于年1月至年9月从温州医院招募。在此病例对照研究中详细描述了受试者的特征。所有病例均经两名经验丰富的病理学家组织学/病理证实。名健康医院接受健康筛查的个体，按性别和年龄分布与病例频率相匹配。所有与会者都提供了书面知情同意。本研究经温州医科大学临床研究伦理委员会批准。
DNA提取和基因分型
用于检测的基因组dna是从先前描述的外周血样本中提取的。我们选择了三个潜在的功能性SNP(rsCT，rsTC和rsGA)。我们还选择了位于5‘UTR区域的rsCT，这在另一项研究中有报道。采用TaqMan实时PCR方法，采用HT序列检测系统(应用生物系统，福斯特市，美国)检测了4个潜在功能SNPs的基因型。在个井中进行了PCR反应，总体积为5μ1，每个井含10ng基因组DNA。至少10%的样本被随机选择并重新分型，以确保分析的准确性。
统计分析
采用X-平方检验，观察胃癌患者与健康对照者在各种特征和基因型频率分布上的差异。采用拟合优度χ2检验，通过比较观察到的基因型频率和预期基因型频率，评估每个SNP的Hardy-Weinberg平衡(HWE)。用Logistic回归法计算OR值及其95%可信区间(Cis)，以评价这4个SNPs与胃癌风险之间的关联强度。我们使用SAS软件管理所有的统计分析(版本9.1；SAS研究所，CARY，NC，美国)。双面P-小于0.05的数值被认为具有统计学意义。
结果
表中显示了这四种多态性的基因型和等位基因频率。4种多态性的基因型频率分布与正常对照组的HWE一致。P=0.(rsCT)，P=0.(rsCT)，P=0.(rsTC)和P=0.(rsGA)。RsGA基因型频率分布在病例组与对照组之间差异有显着性(P0.05)。与RsGG/AG基因型携带者相比，AA基因型携带者胃癌风险显著增加(OR=1.31，95%CI=1.03~1.66)。P=0.)。我们还发现，两种风险基因型的存在显著增加了胃癌的风险(OR=1.52，95%CI=1.13-2.06)。P=0.，调整后的OR=1.44，95%CI=1.03-2.01，P=0.)。此外，携带一种或多种风险基因型的人患胃癌的风险也显著增加(OR=1.32，95%CI=1.04-1.69)。P=0.)。
讨论
尽管有重要的调查结果，但仍应解决一些限制因素。首先，样本量适中，只有例病例和名对照者。相对较小的样本可能无法揭示一些弱的基因-疾病关联和基因-环境相互作用。第二，缺少一些关于个别参与者的其他曝光的有价值的信息，例如幽门螺杆菌感染，职业和当地环境因素，饮食，体育活动。第三，本研究中只包含了4个潜在的功能性SNPs，并且省略了可能与胃癌风险相关的编码区和内含子区域的SNPs。最后，未对所研究的SNP进行功能分析。
总之，本研究提供了四个潜在功能SNPs之间关联的证据。XPG基因和胃癌的风险。特别是，我们发现XPGRsGA多态性与中国汉族胃癌风险略有增加有关。在未来，有必要进行不同种族和较大样本规模的前瞻性研究，以及对机制的调查，以验证其作用。XPGSNPs在胃癌发生中的作用及机制探讨。
参考文献
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