当BenjaminDelory开始撰写关于一种量化植物形态的新方法的论文时,他意识到其中一个图可能很难说明他要表达的东西。他在该论文中提出了一个“永久性条码”(persistencebarcode)的方法来描述植物根系的分支结构。问题是该如何具体说明这一方法。
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本文转载自“生命奥秘”
德国吕讷堡大学(LeuphanaUniversity)的博士后研究员Delory指出,永久性条形码的底层算法是连续和动态的。最好的说明方式是展现动态效果。
科学图表通常呈现为静态图像。但是,这些图表与底层数据是分开的,因此读者无法通过放大感兴趣的特性来更详细地探索图表内的信息。而基因组科学家则需要将数百万个数据点塞进几厘米大的密集视觉图,因此这个问题对于他们来说更为重要。
计算算法的研究人员也会碰到这个问题。科学家经常在开放源代码库(如GitHub)上发布软件,但让代码正常运行说起来容易做起来难。审阅者和其他感兴趣的人通常需要额外的软件和配置来使算法正常运作。
现在一些期刊通过支持交互式数字和代码来填补这个空白。其中之一是FResearch。该期刊去年与加拿大蒙特利尔的计算机公司Plotly和纽约市的CodeOcean平台达成了合作。FResearch的开放精神和数据可视化能力吸引了Delory和他的合作者将论文投到该杂志。该论文于1月份见刊。
1交互式出版物纽约时报(NewYorkTimes)和fivethyeye.北京中科白殿疯眞棒北京白癜风医院是哪家